專利代理人在為發(fā)明人代理專利事務的過程中要履行一定的義務，根據(jù)《專利代理暫行規(guī)定》，專利代理人對在業(yè)務活動中所了解的發(fā)明人的發(fā)明創(chuàng)造，除專利申請已經(jīng)公布或者公告的意外，有保守秘密的責任。除此之外，專利代理人不得代理利益沖突的上方當事人，如許可人與被許可人、出讓人與受讓人、侵權人與被侵權人等，此項義務與一般代理中的代理人不得雙方代理義務是一致的。對于剽竊委托人的發(fā)明創(chuàng)造、故意泄露委托人的發(fā)明創(chuàng)造內容、嚴重損害委托人利益等行為，有關部門可視情節(jié)取消專利代理人的資格，情節(jié)嚴重者追究其法律責任。

    《專利代理管理辦法》第29條還規(guī)定：專利代理人承辦專利代理業(yè)務應當以所在專利代理機構的名義接受委托，與委托人訂立書面委托合同，統(tǒng)一收取費用并如實入帳。專利代理人不得私自接受委托，辦理專利代理業(yè)務并收取費用。

     而且專利代理人每年還要接受由國家知識產權局負責，各省、自治區(qū)、直轄市知識產權局以及國防專利局具體實施的年檢。專利代理人的年檢內容包括：專利代理人是否持有專利代理人執(zhí)業(yè)證，是否按照要求參加執(zhí)業(yè)培訓;專利代理人是否有《專利代理懲戒規(guī)則(試行)》中所列的違法違紀行為。經(jīng)年檢發(fā)現(xiàn)專利代理人不符合法律規(guī)定的，省、自治區(qū)、直轄市知識產權局應當責令其在指定期限內予以改正;逾期不予改正的，給予年檢不合格的結論。經(jīng)年檢發(fā)現(xiàn)專利代理人有《專利代理懲戒規(guī)則(試行)》中的違法違紀行為的，可以提請各省、自治區(qū)、直轄市專利代理懲戒委員會給予懲戒。